音乐研究

深圳大学MUSIC实验室推出一款软件神器,大大提升

 

医生专家的手动标注是医学影像AI研究的基石。标注软件需要尽可能节省医生手动标注的耗时,减少医生标注的痛苦,并帮助医生提高标注的质量与一致性。作为首款国产一站式医学影像标注软件,Pair软件具备专业便捷、通用易用且智能化的特点。

据了解,Pair由深圳大学医学超声影像计算实验室(Medical Ultrasound Image Computing Lab, MUSIC) 的倪东教授和杨鑫博士等带队研发。团队成员10余人,Pair软件历时近3年研发,仍在持续大幅优化中。Pair定位于解决医学影像标注软件长期存在的问题,致力于成为最优秀、最专业、最懂医生的国产医学影像标注软件。Pair自2020年7月于MICS大会公开以来,得到了很多前辈老师的重要指导和批评意见,确立了更多值得解决的问题。Pair目前已基本完成第一阶段基础标注功能的开发,即将进入第二阶段的全面智能化,同时进一步丰富基础标注功能。

此次将对Pair在2021年的重要更新做系统整理与呈现。Pair软件的核心功能亮点如下:

Pair标注功能展示

研究项目通用,兼容各种影像模态和文件格式

Pair可兼容CT、X-Ray、MRI、PET、超声、病理切片、细胞涂片等10余种影像模态,兼容2D、视频、3D、病理、信号、放疗勾画文件等20余种文件格式。所有医学影像AI研究项目可通过Pair完成标注,无需在不同项目间频繁、耗时费力地切换、培训不同的标注软件。

标注功能丰富,覆盖诸多影像AI研究的标注需求

Pair提供测量线、角度、多边形、曲线、曲面、矩形框、关键点、分类标签、文本属性、时间轴、切面等20多项标注功能,涵盖测量、分割、分类、目标检测、关键点定位、动作预测等常见影像AI分析所需的标注类型。更重要的,Pair支持标注功能与类型的混合使用,充分适应复杂的研究与标注需求。

智能辅助标注,让医生从繁重的手动标注中解脱

Pair提供多层次的智能化辅助标注功能,可大幅减轻医生的手动标注工作量。Pair提供阈值分割、魔术棒、曲线拟合、矩形框跟踪、标签记忆/复制等自动化辅助标注功能。Pair尤其配备独有的用户自定义AI标注和通用智能分割标注AutoSeg。两项功能均可搭载深度学习模型,仅需普通电脑CPU,即可实现对解剖结构的一键式智能标注。

标注流程规范化,支持大规模影像标注任务

Pair提供标注标签的配置和管理功能,可有效避免标注者因误操作或个人习惯而引发的标签错用和标注功能误用,从而实现标注流程的规范化,有效降低标注结果的噪声。Pair通过优化内存管理,可支持同时导入超1000例影像文件进行标注,支持2万帧的超大视频文件标注,支持2GB以上病理影像文件的标注。

病例隐私脱敏和影像加密,为研究项目提供安全保障

病例的隐私和影像是AI研究的宝贵资源,且面临日益严重的泄露风险。通用易用的隐私脱敏工具和支持加密的标注软件仍旧缺乏。Pair因此提供了完善的脱敏功能、多层权限的高阶加解密标注功能,以实现病例隐私、医学影像以及标注资源的多重安全。

简洁易用的工作流,持续完善和丰富的教程用例资源

Pair拥有简洁和直觉化的标注逻辑设计,以方便医生快速入手并减少标注交互的耗时。Pair提供详细的文档说明及视频演示,便于用户快速熟悉软件的操作流程,节省标注的培训耗时。截止目前,Pair已更新15期制作精良的视频教程,并将陆续邀请多位医生专家分享使用Pair做高效标注的案例。

Pair与现有标注软件的功能对比

截止目前,Pair已基本完成基础功能框架的研发,正在朝全面智能化的方向快速前进,以进一步减轻医生手动标注的痛苦。Pair保持高频的更新优化进度,追求对标注功能设计的极致专业,致力于成为基础重要软件。Pair在2021年内已进行如下多项重要功能的更新与优化:

  • 通用智能分割标注AutoSeg

  • 用户自定义AI模型的辅助标注

  • 视频时间轴事件标注

  • 多模态影像互补标注

  • 全面支持放疗勾画的DICOM RT Struct

  • 病例隐私脱敏和影像信息安全化软件PairCode

  • 实现Windows / Ubuntu / CentOS版本

下面我们将详细介绍各大重要功能更新(备注:本文所示所有医学影像均已做隐私信息脱敏处理):

AutoSeg --- 通用的一键式智能分割精细标注